A partir do pack 2024.R1-S3, a forma como o sistema faz o cálculo para a tarefa mencionada acima, levará em consideração a configuração desta redução nas regras de tributação e também se nas opções da Natureza de Operação, está marcada a opção Aplicar redução de icms:

Sem esta opção o sistema não levará o cálculo em consideração.